Servicios

1.- En Bioinformática

Formación y consultoria

  • Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades bioinformáticas en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior
  • Formación personalizada y de grupo en Bioinformática y modelización matemática
  • Asesoría y soporte a los usuarios de herramientas y métodos bioinformáticos

Análisis estándar

  • Ensamblaje de novo y anotación de genomas procarióticos
  • Análisis de variantes con genoma de referencia en procariotas y eucariotas
  • Análisis de expresión genética (MicroArray & RNAseq) para identificación de genes con expresión diferencial
  • Análisis y optimización de expresión de secuencias biológicas (uso de codones más frecuentes)
  • Modelización y predicción de estructuras de proteínas
  • Visualización de datos en mapas de redes biológicas

Análisis especializados

  • Análisis cualitativo y cuantitativo de resultados de experimentos ómicos
  • Análisis de datos
  • Otros proyectos no estándar

 

2.- En Biología Computacional

Formación y consultoría

  • Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades de biología computacional en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior
  • Formación personalizada y de grupo en métodos de biología computacional
  • Asesoría y soporte a los usuarios en la utilización de software de modelización matemática en biología, biomedicina y biotecnología

Análisis especializados

  • Creación de “digital twins” de procesos biológicos para análisis y optimización de los mismos.
  • Modelos compartimentales
  • Análisis de sensibilidades y evaluación de escenarios ‘what if…’ (in silico experiments)

 

Equipamientos

  • 2 Servidores, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon (24 nodos de computación) a 2.0 GHz, 124 GB RAM, para cálculos intensivos.
  • 4 workstations HP serie Z, con procesadores intel Xeon y 8 nodos de computación.
  • 3 PC de altas prestaciones HP.

Tipo de servicio

Cliente interno

Cliente público externo 

Cliente privado externo

Formación y consultoría 

45€/h

65€/h

85€/h

Análisis estándar 

45€/h

65€/h

85€/h

Análisis especializados

A acordar caso a caso

A acordar caso a caso

A acordar caso a caso

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Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves

RESPONSABLE CIENTÍFIC

Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves

Departament de Ciències Mèdiques Bàsiques
Facultat de Medicina
Edifici de Recerca Biomédica II
4ª Planta. Av. Rovira Roure 80
25198 Lleida

Tlf: 973 702425
rui.alves@udl.cat

 

EQUIP

Jorge Sebastian Comas Pereyra
Alberto Marin Sanguino
Albert Sorribas Tello
Ester Vilaprinyó Terre
 

Grup de Biomodels

Departament de Ciències Mèdiques Bàsiques
Facultat de Medicina / Edifici de Recerca Biomédica II / Laboratori 4.11
Av. Rovira Roure 80, 25198 Lleida

973 702 425
rui.alves@udl.cat